More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
245 aa  481  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  64.56 
 
 
277 aa  299  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.77 
 
 
274 aa  287  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  62.34 
 
 
258 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  63.68 
 
 
250 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.47 
 
 
280 aa  278  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  63.13 
 
 
271 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  65.58 
 
 
268 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  59.13 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  59.55 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  64.71 
 
 
257 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.32 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  60.43 
 
 
252 aa  271  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  61.36 
 
 
247 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  60.36 
 
 
256 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  57.02 
 
 
263 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  56.72 
 
 
255 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.26 
 
 
264 aa  268  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  61.43 
 
 
258 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  58.22 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  59.39 
 
 
258 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  59.45 
 
 
256 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  59.35 
 
 
255 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  55.04 
 
 
259 aa  261  6e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  58.48 
 
 
258 aa  261  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  58.53 
 
 
264 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  59.35 
 
 
255 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  59.55 
 
 
253 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  60.19 
 
 
445 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  58.67 
 
 
266 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  56.83 
 
 
262 aa  255  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.01 
 
 
291 aa  254  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  60.18 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  57.14 
 
 
455 aa  250  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.95 
 
 
228 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  53.88 
 
 
288 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  59.82 
 
 
258 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  57.41 
 
 
250 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  56.33 
 
 
279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  58.85 
 
 
253 aa  244  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  58.41 
 
 
245 aa  242  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
255 aa  242  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53.68 
 
 
279 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  56.42 
 
 
252 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  55.56 
 
 
293 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
247 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  51.43 
 
 
225 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.81 
 
 
269 aa  235  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.42 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.35 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  56.13 
 
 
256 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.91 
 
 
230 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.77 
 
 
249 aa  231  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
227 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  54.5 
 
 
266 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  48.39 
 
 
225 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
241 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  56.82 
 
 
277 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.25 
 
 
255 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
271 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
261 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  49.54 
 
 
229 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
248 aa  221  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  52.42 
 
 
253 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.44 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.07 
 
 
226 aa  217  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.46 
 
 
269 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.35 
 
 
224 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  53.27 
 
 
257 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.2 
 
 
227 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.05 
 
 
238 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  48.76 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.12 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  55.25 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  53 
 
 
272 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  54.09 
 
 
248 aa  211  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
246 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
244 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
229 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
233 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
231 aa  207  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48.44 
 
 
228 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  47.6 
 
 
235 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 
231 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.98 
 
 
225 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.62 
 
 
240 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.4 
 
 
235 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
228 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
229 aa  206  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  46.46 
 
 
229 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
227 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
221 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.98 
 
 
239 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  48.17 
 
 
226 aa  204  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.43 
 
 
238 aa  204  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
230 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>