156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6540 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  230  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  47.14 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  51.52 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  52.86 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  49.25 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  42.03 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  48.68 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  38.89 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  47.06 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  50.85 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  50.85 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  36.84 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  42.86 
 
 		 75 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  43.4 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.52 
 
 		 236 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  31.88 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.23 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 256 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  32.91 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 390 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0024  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  41.07 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  32.65 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  32.43 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>