More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5768 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6180  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.07 
 
 		 498 aa  841    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0879819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6151  RND efflux system outer membrane lipoprotein  90.16 
 
 		 502 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.808287  normal  0.205282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  91.13 
 
 		 499 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6626  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  72.54 
 
 		 508 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6660  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.29 
 
 		 498 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 499 aa  982    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5459  RND efflux system outer membrane lipoprotein  74.38 
 
 		 493 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.0370061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2615  aromatic acid efflux system NodT family outer membrane lipoprotein  74.51 
 
 		 510 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  98.8 
 
 		 499 aa  971    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  55.19 
 
 		 477 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5048  RND efflux system outer membrane lipoprotein  58.55 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0179  RND efflux transporter  58.55 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3381  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  55.39 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0204  RND efflux system outer membrane lipoprotein  57.94 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0200  RND efflux system outer membrane lipoprotein  57.88 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.844152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0174  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  56.87 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4790  NodT family outer membrane lipoprotein  47.3 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.031941  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.07 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.940434  normal  0.118266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3498  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.27 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.916304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0870  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.32 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0108  outer membrane efflux protein  46.37 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.998776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4319  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.32 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.239033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3167  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.01 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1154  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.3 
 
 		 473 aa  292  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182996  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.25 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4288  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.02 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22095  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.02 
 
 		 497 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3191  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.02 
 
 		 497 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.48 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2929  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.91 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.65 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2069  multidrug efflux MFS outer membrane protein, putative  36.65 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  35.54 
 
 		 465 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.56 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1101  outer membrane protein  35.93 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.15 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.76 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 471 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.13 
 
 		 471 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.13 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2115  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.97 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  33.61 
 
 		 503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.19 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.9 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.74 
 
 		 473 aa  207  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  34.2 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  28.99 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32380  multidrug efflux outer membrane protein OprN precursor  35.2 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0450823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  28.99 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.06 
 
 		 512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1301  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.29 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2743  outer membrane protein OprN precursor  33.88 
 
 		 472 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.85 
 
 		 494 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  32.57 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.62 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.68 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.71 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4126  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.33 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48240  putative outer membrane component of multidrug efflux pump  39.03 
 
 		 482 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0030067  normal  0.0214896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.61 
 
 		 531 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  29.21 
 
 		 558 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.2 
 
 		 495 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32 
 
 		 495 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.82 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.84 
 
 		 525 aa  180  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.49 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.9 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  32.4 
 
 		 479 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.21 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  33.05 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.89 
 
 		 518 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.21 
 
 		 513 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.34 
 
 		 495 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.17 
 
 		 511 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.88 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  29.66 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  30.87 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  30.64 
 
 		 547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.85 
 
 		 494 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.57 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.62 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  34.36 
 
 		 499 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5379  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320478  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1006  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0211246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.47 
 
 		 503 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.918566  hitchhiker  0.00837312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3623  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.47 
 
 		 503 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09500  outer membrane protein  32.45 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  33.4 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5539  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.26 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.541532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.84 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0630  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.46 
 
 		 569 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00465168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>