More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1518 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  100 
 
 
343 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  86.53 
 
 
450 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  86.53 
 
 
416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  86.53 
 
 
416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  86.53 
 
 
416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  84.46 
 
 
351 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  83.53 
 
 
416 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  88.67 
 
 
343 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  74.83 
 
 
289 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  74.83 
 
 
289 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  74.3 
 
 
288 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  71.68 
 
 
297 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  74.35 
 
 
273 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  76.47 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  77.51 
 
 
290 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  58.33 
 
 
282 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  59.35 
 
 
255 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  54.48 
 
 
273 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  55.73 
 
 
276 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  57.32 
 
 
271 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  55.65 
 
 
285 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  47.06 
 
 
274 aa  269  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  55.51 
 
 
269 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  55.73 
 
 
273 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  49.82 
 
 
278 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  47.1 
 
 
283 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  48.52 
 
 
272 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 
279 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  49.64 
 
 
277 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  49.45 
 
 
280 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  48.15 
 
 
274 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  53.49 
 
 
256 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  49.81 
 
 
275 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  48.63 
 
 
289 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  50.36 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  43.7 
 
 
272 aa  230  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  41.26 
 
 
275 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  43.49 
 
 
350 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  31.16 
 
 
295 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  29.71 
 
 
263 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  27.92 
 
 
274 aa  92.8  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  29.41 
 
 
251 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  31.35 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 
249 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  31.79 
 
 
279 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  32.63 
 
 
270 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  29.92 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  31.38 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  25.63 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  33.68 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  31.87 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  28.29 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  28.57 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.15 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  29.82 
 
 
247 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.67 
 
 
269 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.63 
 
 
251 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  31.38 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  28.41 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  27.27 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  31.47 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  31.96 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  31.52 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  29.12 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  29.01 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  28.73 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  35.09 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  33.9 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  30.49 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  29.34 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  28.08 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  29.78 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.05 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.39 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  26.52 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  29.33 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  30.92 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  30.11 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  28.95 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  33.17 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  32.16 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  23.59 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  30.94 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  30.22 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  26.98 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  25.78 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  32.42 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.87 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  32.09 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  32.56 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  32.75 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  32.56 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  31.61 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  25 
 
 
243 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  33.53 
 
 
236 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  27.68 
 
 
247 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  32.22 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  32.95 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>