More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5197 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 		 607 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  34.29 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  34.11 
 
 		 426 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4096  secretion protein HlyD family protein  34.44 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4025  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3732  secretion protein HlyD family protein  30.9 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0895  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3980  secretion protein HlyD family protein  31.27 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2470  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.67 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0039  macrolide-specific efflux protein  25.91 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.461256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03081  ABC transporter ATP-binding protein  29.6 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.955285 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2851  hypothetical protein  23.27 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2991  hypothetical protein  23.02 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.26 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.94 
 
 		 505 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  31.2 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.91 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 549 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.54 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  29.19 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  31.77 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  28.71 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.72 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  28.16 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  30.12 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  23.72 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  34.16 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.39 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.91 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.93 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  23.24 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.12 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.61 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  23.64 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  23.64 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  23.24 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  23.24 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  23.64 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  23.64 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  23.64 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  23.64 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.64 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  23.24 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  27.17 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  25 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  23.64 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  23.64 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.64 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.37 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  29.3 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  25.06 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.7 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  23.88 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  23.43 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1469  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.98 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  26.1 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.21 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  24.75 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.44 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  23.43 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.01 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  26 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.74 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>