More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0217 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  53.7 
 
 
862 aa  837    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  51.9 
 
 
843 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
850 aa  1721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  65.05 
 
 
859 aa  1112    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  52.64 
 
 
864 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  39.81 
 
 
837 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  41.31 
 
 
817 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  40.69 
 
 
860 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  39.95 
 
 
815 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  39.71 
 
 
825 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 
825 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  35.59 
 
 
711 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.71 
 
 
709 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 
708 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 
708 aa  366  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  36.91 
 
 
712 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 
743 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 
741 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 
709 aa  340  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 
710 aa  340  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  36.77 
 
 
689 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 
726 aa  337  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 
710 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
701 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 
715 aa  334  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.53 
 
 
708 aa  334  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 
689 aa  331  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 
730 aa  331  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 
734 aa  331  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.19 
 
 
703 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 
701 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.04 
 
 
703 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.94 
 
 
711 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 
757 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 
722 aa  325  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  34.16 
 
 
696 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
703 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 
701 aa  321  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  35.51 
 
 
722 aa  318  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 
792 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 
722 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 
696 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
736 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 
710 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 
701 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 
726 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 
701 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 
689 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 
738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 
732 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 
701 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 
701 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 
701 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 
714 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
713 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  34.19 
 
 
703 aa  297  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 
723 aa  293  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
724 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 
724 aa  291  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
707 aa  286  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 
742 aa  286  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 
797 aa  283  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 
829 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
770 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
789 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 
710 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 
719 aa  277  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 
769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 
812 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 
819 aa  275  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 
710 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 
715 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 
707 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
702 aa  270  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
702 aa  270  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 
700 aa  270  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 
821 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
714 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 
757 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 
720 aa  267  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 
720 aa  267  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 
720 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 
749 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 
720 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  31.5 
 
 
716 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 
721 aa  265  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 
706 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
720 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  31.47 
 
 
699 aa  265  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 
709 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 
706 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
689 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
698 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 
689 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.92 
 
 
806 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
712 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 
730 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
715 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>