More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4441 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  44.61 
 
 		 4183 aa  748    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  47.57 
 
 		 4111 aa  1691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.96 
 
 		 1867 aa  1384    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  47.58 
 
 		 2113 aa  1180    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.62 
 
 		 4080 aa  1868    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  39.39 
 
 		 2225 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.57 
 
 		 1143 aa  866    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.25 
 
 		 1837 aa  1025    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.68 
 
 		 2890 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.11 
 
 		 1955 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  56 
 
 		 3254 aa  881    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.65 
 
 		 2024 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.97 
 
 		 2719 aa  988    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.73 
 
 		 2066 aa  1087    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  51.48 
 
 		 2374 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.94 
 
 		 1602 aa  1004    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  47.36 
 
 		 2060 aa  858    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  49.1 
 
 		 1831 aa  1387    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.19 
 
 		 2230 aa  731    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  48.49 
 
 		 1573 aa  732    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 1874 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  56.16 
 
 		 1593 aa  857    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  48.57 
 
 		 1077 aa  725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.95 
 
 		 1832 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  47.41 
 
 		 2367 aa  993    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  47.05 
 
 		 3930 aa  1360    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.68 
 
 		 3148 aa  1241    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  62.43 
 
 		 3670 aa  1482    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.79 
 
 		 3645 aa  1097    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 		 3874 aa  1306    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.9 
 
 		 3508 aa  1715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  38.77 
 
 		 1827 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.88 
 
 		 3494 aa  1880    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48 
 
 		 2081 aa  736    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.66 
 
 		 2078 aa  922    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  45.93 
 
 		 4575 aa  1105    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  53.55 
 
 		 5154 aa  1882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  52.26 
 
 		 3033 aa  788    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  53.92 
 
 		 3158 aa  1046    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.64 
 
 		 3493 aa  1297    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.86 
 
 		 5400 aa  1846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  41.42 
 
 		 3693 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.24 
 
 		 2376 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  44.33 
 
 		 3449 aa  1258    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.7 
 
 		 2020 aa  929    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  49 
 
 		 1820 aa  1373    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.54 
 
 		 2085 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  56.88 
 
 		 1584 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  47.97 
 
 		 2277 aa  1303    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  50.56 
 
 		 2107 aa  1265    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  100 
 
 		 2966 aa  5683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 1939 aa  780    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  47.87 
 
 		 2847 aa  1176    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  53.82 
 
 		 5255 aa  2032    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  52.05 
 
 		 1789 aa  1479    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.46 
 
 		 1305 aa  870    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  54.9 
 
 		 7279 aa  2060    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  39.79 
 
 		 2220 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 		 1924 aa  1266    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.78 
 
 		 2090 aa  1291    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  56.99 
 
 		 1601 aa  939    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  52.04 
 
 		 2126 aa  1185    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  41.42 
 
 		 3693 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  52.68 
 
 		 3463 aa  1882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  52.46 
 
 		 1114 aa  867    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39 
 
 		 2136 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  54.47 
 
 		 3408 aa  1939    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.54 
 
 		 2085 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  52.2 
 
 		 3711 aa  1907    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.54 
 
 		 3176 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  41.29 
 
 		 3676 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.11 
 
 		 1101 aa  811    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  42.35 
 
 		 3696 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.67 
 
 		 4930 aa  1732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 		 1805 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  40.91 
 
 		 3281 aa  934    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  52.59 
 
 		 6768 aa  1142    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.83 
 
 		 7110 aa  2095    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  45.91 
 
 		 4840 aa  1196    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  54.46 
 
 		 7210 aa  2076    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  51.49 
 
 		 1548 aa  799    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.37 
 
 		 2232 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 		 3702 aa  708    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.55 
 
 		 1071 aa  761    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  44.4 
 
 		 4882 aa  1210    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.1 
 
 		 3355 aa  2038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.54 
 
 		 2085 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  48.16 
 
 		 2108 aa  1158    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  52.62 
 
 		 2846 aa  1006    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 		 2333 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.89 
 
 		 4151 aa  1145    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 		 3679 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.58 
 
 		 3092 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.94 
 
 		 1816 aa  1325    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.99 
 
 		 1126 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  45.3 
 
 		 4264 aa  1481    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.57 
 
 		 4607 aa  1025    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.87 
 
 		 1587 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.24 
 
 		 1354 aa  630  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.26 
 
 		 4478 aa  629  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>