143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0088 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 		 400 aa  808    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  71.39 
 
 		 395 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  68.59 
 
 		 388 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  68.77 
 
 		 388 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  65.09 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.02 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  65.25 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  65.11 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  63.77 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.81 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  64.16 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.31 
 
 		 406 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  62.81 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.48 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  62.9 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  61.81 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  59.9 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  52.91 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  51 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.1 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  47.74 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.49 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  47.72 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  47.49 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  49.37 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  46.97 
 
 		 385 aa  358  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  47.61 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.61 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.43 
 
 		 385 aa  336  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  44.61 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  39.4 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.9 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.15 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  39.4 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  39.15 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.65 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  39.4 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.69 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.15 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  39.15 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.3 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.95 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  39.9 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.65 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  37.69 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  41.75 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  41.49 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.49 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  40.86 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  37.88 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  32.24 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.51 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  31.99 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.55 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.16 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  33.14 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.65 
 
 		 368 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.65 
 
 		 368 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.4 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.08 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  24.94 
 
 		 448 aa  76.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.88 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.75 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.12 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.84 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.82 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.92 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.89 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.85 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.31 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.74 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.74 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.75 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.35 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.39 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.56 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  24.82 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.82 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.62 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.9 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.88 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.75 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.47 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.21 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.43 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.56 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.05 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.75 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.17 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.56 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>