More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0191 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  100 
 
 
305 aa  587  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  47.04 
 
 
309 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
302 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
308 aa  215  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.48 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  53.11 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  44.85 
 
 
312 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  41.06 
 
 
311 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.95 
 
 
300 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  54.42 
 
 
374 aa  205  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  45.14 
 
 
388 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.52 
 
 
308 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  42.62 
 
 
315 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  43.09 
 
 
308 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  43.79 
 
 
308 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  41.92 
 
 
310 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  41.92 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  41.92 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  42.81 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  41.14 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
338 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  51.09 
 
 
299 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35 
 
 
304 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  41.92 
 
 
319 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.98 
 
 
322 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
306 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
314 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 
313 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.27 
 
 
324 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.6 
 
 
302 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  41.81 
 
 
322 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
301 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  43.29 
 
 
294 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  46.53 
 
 
322 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
237 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  44 
 
 
322 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  45.25 
 
 
334 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  49.25 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  38.71 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  46.36 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  34.74 
 
 
305 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
285 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
305 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
281 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.92 
 
 
326 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  36.61 
 
 
254 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  40 
 
 
256 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  36.15 
 
 
284 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  37.86 
 
 
324 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
302 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.19 
 
 
331 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  42.09 
 
 
297 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  38.79 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.24 
 
 
321 aa  165  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.69 
 
 
286 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  39.49 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  33.93 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  46.51 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
342 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.77 
 
 
305 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.63 
 
 
321 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
301 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
314 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 
280 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
301 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
310 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
294 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
312 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.44 
 
 
301 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
301 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  41.28 
 
 
741 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.54 
 
 
313 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  37.79 
 
 
295 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.59 
 
 
308 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  38.68 
 
 
290 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
323 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
332 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.39 
 
 
316 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.44 
 
 
347 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.51 
 
 
282 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  35.28 
 
 
304 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  47.8 
 
 
323 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 
353 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.65 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 
316 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
319 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  30.19 
 
 
311 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.83 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>