More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2827 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  100 
 
 
487 aa  975    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  97.33 
 
 
484 aa  873    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  71.19 
 
 
490 aa  709    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  65.11 
 
 
477 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  38.09 
 
 
482 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  38.74 
 
 
484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  38.92 
 
 
517 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  37.39 
 
 
461 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  37.39 
 
 
461 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  37.72 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  37.33 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  36.93 
 
 
482 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.38 
 
 
493 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 
474 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  36.93 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  38.04 
 
 
496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.63 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 
455 aa  232  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  33.64 
 
 
526 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 
461 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  34.88 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  32.17 
 
 
478 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  34.21 
 
 
574 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.24 
 
 
466 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.21 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  32.03 
 
 
530 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  35.51 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  33.01 
 
 
473 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  33.73 
 
 
460 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.91 
 
 
514 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.13 
 
 
443 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  33.66 
 
 
460 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  32.01 
 
 
493 aa  209  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  31.28 
 
 
633 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  34.24 
 
 
469 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.45 
 
 
460 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 
444 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  30.57 
 
 
663 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
441 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
432 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
432 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
441 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
441 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
441 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
432 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  34.05 
 
 
454 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
468 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  33.09 
 
 
441 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 
419 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 
657 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  32.17 
 
 
656 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  33.82 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  33.82 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  33.82 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  33.88 
 
 
443 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  34.36 
 
 
507 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 
620 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  32.65 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  32.1 
 
 
652 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  33.8 
 
 
457 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  32.21 
 
 
571 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  34.04 
 
 
419 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  32.26 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  35.54 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  34.81 
 
 
416 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  33.85 
 
 
478 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 
478 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  31.93 
 
 
487 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  33.25 
 
 
492 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  32.53 
 
 
486 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 
646 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  30.69 
 
 
539 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 
642 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 
642 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  32.41 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  32.41 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  32.41 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  32.41 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  32.41 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  32.41 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  31.95 
 
 
502 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  32 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 
491 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31.87 
 
 
494 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  30.09 
 
 
679 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  33.42 
 
 
454 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  33.42 
 
 
454 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  29.81 
 
 
700 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  32.65 
 
 
493 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 
504 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 
492 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  32.77 
 
 
454 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  29.64 
 
 
595 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  31.32 
 
 
479 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  31.72 
 
 
502 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 
431 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  34.34 
 
 
491 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  29.61 
 
 
634 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  31.32 
 
 
480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  30.87 
 
 
603 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>