252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0686 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 349 aa  688    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  49.39 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  45.65 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  42.51 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  42.22 
 
 		 367 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  41.92 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  39.53 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  40.59 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  37.32 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  39.82 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  31.44 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  33.57 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  31.89 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  33.23 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  31.95 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.8 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  28.92 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  34.08 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.34 
 
 		 362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  29.18 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.22 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  32.74 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  27.62 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  30.47 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  25.6 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.97 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  28.7 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  32.55 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  30.4 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  29.38 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.33 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  28.48 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  31.12 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  28.08 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  28.08 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.27 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  26.43 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  28.08 
 
 		 400 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  34.18 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  28.81 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  28.08 
 
 		 273 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  29.21 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  24.8 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4294  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  27.3 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  22.67 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  22.01 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.91 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  45 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  26.37 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  24.59 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  25.68 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 175 aa  57  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  28.46 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 105 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  29.92 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 505 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  36.29 
 
 		 141 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 135 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  30.32 
 
 		 173 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 151 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  21.86 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  26.15 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  25.99 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  40.35 
 
 		 144 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 194 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.32 
 
 		 174 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  22.59 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  35 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  30.63 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  43.1 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 199 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>