More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3406 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0179  GntR family transcriptional regulator  77.41 
 
 		 241 aa  353  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  38.53 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2470  transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  37.23 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  38.07 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  38.07 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  37.22 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  33.03 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  34.51 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08380  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.77 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.02 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  28.08 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  26.15 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.6 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.61 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.97 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.29 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  34.17 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  29.67 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.64 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  31.17 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  28.99 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  37.11 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  28.57 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  34.2 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.14 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.3 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.58 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.95 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  30.28 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  31.68 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  28.14 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  27.1 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.38 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.31 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  34.81 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  27.54 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  29.72 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  29.72 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  29.72 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  29.67 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  32.23 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  30.41 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  27.73 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  25.91 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  28.44 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  28.44 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  30.41 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.37 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  28.99 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  28.32 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  26.45 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  38.82 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  28.37 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  26.09 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.26 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>