72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0036 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  100 
 
 
325 aa  666  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  82.09 
 
 
296 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  56.25 
 
 
454 aa  282  7e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  47.69 
 
 
291 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  46.74 
 
 
286 aa  223  5e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  44.4 
 
 
288 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  39.55 
 
 
291 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  39.18 
 
 
291 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  37.13 
 
 
299 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.78 
 
 
306 aa  118  1e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  30.69 
 
 
304 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  29.02 
 
 
296 aa  111  2e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  28.37 
 
 
303 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  26.46 
 
 
302 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  28.82 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  27.78 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  27.03 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.09168e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  30 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  25.99 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  25.99 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  27.72 
 
 
312 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  27.18 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  28.32 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  36.76 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  29.03 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  26.32 
 
 
293 aa  85.5  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  27.45 
 
 
305 aa  83.6  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  27.45 
 
 
305 aa  83.6  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  26.8 
 
 
304 aa  81.6  2e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  37.5 
 
 
349 aa  76.6  5e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  27.46 
 
 
307 aa  76.6  5e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  26.71 
 
 
305 aa  76.3  6e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  34.07 
 
 
493 aa  75.1  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  36.36 
 
 
345 aa  69.3  7e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  25.66 
 
 
304 aa  69.3  7e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  25.82 
 
 
304 aa  68.6  1e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  25.82 
 
 
304 aa  68.6  1e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  25.1 
 
 
297 aa  68.9  1e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  26.85 
 
 
305 aa  66.6  5e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  25.29 
 
 
303 aa  66.6  6e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  25.6 
 
 
297 aa  66.6  6e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  25.17 
 
 
306 aa  66.2  7e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  37.61 
 
 
364 aa  62.8  9e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  31.34 
 
 
215 aa  62.4  1e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  37.07 
 
 
421 aa  60.8  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  26.54 
 
 
301 aa  60.1  5e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  25.88 
 
 
311 aa  58.9  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  39.66 
 
 
368 aa  57.4  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  22.11 
 
 
304 aa  57  5e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  36.3 
 
 
252 aa  56.6  5e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.46 
 
 
305 aa  56.2  8e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  29.63 
 
 
450 aa  54.7  2e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  26.7 
 
 
300 aa  54.3  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  36.04 
 
 
250 aa  53.9  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37.37 
 
 
359 aa  53.5  5e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  40 
 
 
128 aa  52.8  7e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  39.81 
 
 
208 aa  52  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  32.43 
 
 
222 aa  52.4  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  30.81 
 
 
333 aa  50.4  4e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  35.29 
 
 
219 aa  49.3  8e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  33.07 
 
 
493 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.98 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  30.08 
 
 
187 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  25.61 
 
 
349 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  30.16 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.04 
 
 
440 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  28.68 
 
 
184 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  32.65 
 
 
585 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0449  restriction endonuclease  30.71 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.679724  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.04 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  30.43 
 
 
200 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  34.48 
 
 
262 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>