More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0092 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.85 
 
 
981 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
995 aa  2019    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.07 
 
 
1055 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.21 
 
 
991 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.13 
 
 
996 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  44.44 
 
 
1029 aa  818    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  40.38 
 
 
1001 aa  697    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.34 
 
 
995 aa  715    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.28 
 
 
990 aa  769    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.19 
 
 
991 aa  935    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  44.05 
 
 
622 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  40.09 
 
 
619 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  40.06 
 
 
624 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  42.02 
 
 
638 aa  399  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  37.8 
 
 
607 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  40.44 
 
 
595 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 
605 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.74 
 
 
856 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.21 
 
 
856 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  40.63 
 
 
594 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.55 
 
 
853 aa  365  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.9 
 
 
989 aa  357  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.75 
 
 
845 aa  354  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.86 
 
 
848 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.65 
 
 
844 aa  353  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  33.67 
 
 
849 aa  351  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.18 
 
 
849 aa  350  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.89 
 
 
761 aa  345  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.38 
 
 
844 aa  345  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  35.06 
 
 
759 aa  342  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.79 
 
 
846 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.8 
 
 
839 aa  342  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.13 
 
 
834 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.6 
 
 
735 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.36 
 
 
843 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.42 
 
 
846 aa  326  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.58 
 
 
740 aa  322  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.54 
 
 
759 aa  318  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.35 
 
 
1400 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.94 
 
 
785 aa  313  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.94 
 
 
785 aa  313  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.77 
 
 
844 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.14 
 
 
756 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.96 
 
 
750 aa  304  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  35.14 
 
 
793 aa  300  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.74 
 
 
762 aa  296  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.01 
 
 
750 aa  290  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.14 
 
 
885 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  51.81 
 
 
554 aa  287  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.7 
 
 
748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  40.62 
 
 
532 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  49.29 
 
 
530 aa  281  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  41.81 
 
 
532 aa  278  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  49.1 
 
 
533 aa  277  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.44 
 
 
755 aa  277  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  52.69 
 
 
533 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  49.62 
 
 
531 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  46.9 
 
 
525 aa  275  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.18 
 
 
754 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.18 
 
 
754 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  48.91 
 
 
554 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.02 
 
 
754 aa  274  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.02 
 
 
754 aa  274  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  45.33 
 
 
533 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  45.3 
 
 
532 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.12 
 
 
754 aa  273  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.18 
 
 
754 aa  273  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.02 
 
 
754 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.02 
 
 
754 aa  272  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  44.15 
 
 
533 aa  272  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.01 
 
 
752 aa  271  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  48.48 
 
 
530 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.86 
 
 
754 aa  270  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  43.63 
 
 
532 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  51.67 
 
 
554 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.74 
 
 
473 aa  270  8.999999999999999e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  31.79 
 
 
613 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  31.4 
 
 
613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.53 
 
 
858 aa  267  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  51.67 
 
 
554 aa  267  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  32.77 
 
 
534 aa  267  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  51.67 
 
 
554 aa  267  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  46.93 
 
 
526 aa  266  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  46.74 
 
 
532 aa  262  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  30.49 
 
 
734 aa  263  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  46.97 
 
 
530 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  46.38 
 
 
533 aa  260  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  47.37 
 
 
533 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  44.93 
 
 
533 aa  258  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  31 
 
 
613 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.35 
 
 
911 aa  257  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  46.38 
 
 
533 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  46.21 
 
 
556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  46.55 
 
 
529 aa  253  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.24 
 
 
763 aa  253  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  46.07 
 
 
554 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  45.96 
 
 
535 aa  251  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  47.35 
 
 
524 aa  250  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  47.74 
 
 
526 aa  249  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  45.33 
 
 
521 aa  249  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>