More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2015 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2015  Peptidase M23  100 
 
 		 167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  67.8 
 
 		 299 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  65.25 
 
 		 292 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  64.41 
 
 		 292 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  65.25 
 
 		 303 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  65.25 
 
 		 303 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  65.22 
 
 		 318 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  62.61 
 
 		 301 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  62.71 
 
 		 298 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  62.71 
 
 		 295 aa  158  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  60.16 
 
 		 287 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  62.16 
 
 		 317 aa  151  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  59.32 
 
 		 315 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  61.61 
 
 		 295 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  54.92 
 
 		 270 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  59.82 
 
 		 274 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  56.52 
 
 		 312 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  59.82 
 
 		 275 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  56.52 
 
 		 315 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  55.08 
 
 		 236 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  56.52 
 
 		 311 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  49.01 
 
 		 293 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  55.93 
 
 		 295 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  47.74 
 
 		 230 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  56.9 
 
 		 333 aa  140  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  58.04 
 
 		 268 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  54.24 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  54.24 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  54.24 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  54.24 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  54.24 
 
 		 296 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  55.46 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  54.24 
 
 		 296 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  51.09 
 
 		 292 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  53.28 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  55.65 
 
 		 295 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  55.08 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  48.59 
 
 		 262 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  55.65 
 
 		 294 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  55.65 
 
 		 296 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  55.65 
 
 		 296 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  55.65 
 
 		 295 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  48.59 
 
 		 262 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  55.65 
 
 		 296 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  56.41 
 
 		 297 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  54.78 
 
 		 292 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  54.78 
 
 		 296 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  54.78 
 
 		 298 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  54.78 
 
 		 296 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  54.78 
 
 		 296 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  54.78 
 
 		 296 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  54.78 
 
 		 296 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  54.78 
 
 		 292 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  55.65 
 
 		 238 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  48.57 
 
 		 285 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  46.15 
 
 		 284 aa  137  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  48.91 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  53.39 
 
 		 304 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  55.65 
 
 		 236 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  50.68 
 
 		 261 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  47.37 
 
 		 327 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  48.84 
 
 		 249 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  46.41 
 
 		 327 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  47.37 
 
 		 327 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  53.66 
 
 		 272 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  58.04 
 
 		 307 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  56.76 
 
 		 240 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  52.14 
 
 		 288 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  55.26 
 
 		 293 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  50.41 
 
 		 285 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  51.09 
 
 		 304 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  52.89 
 
 		 328 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 377 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  51.2 
 
 		 311 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 377 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 377 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 377 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 377 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  55.56 
 
 		 289 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  50.38 
 
 		 298 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  50 
 
 		 309 aa  130  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  50.38 
 
 		 310 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  44 
 
 		 401 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  49.19 
 
 		 374 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  50 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  49.22 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  50.79 
 
 		 290 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  51.67 
 
 		 311 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  47.45 
 
 		 250 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  47.45 
 
 		 250 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  47.45 
 
 		 250 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  53.51 
 
 		 379 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  53.51 
 
 		 363 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  53.51 
 
 		 379 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  47.45 
 
 		 250 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  53.51 
 
 		 379 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  53.51 
 
 		 379 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  53.51 
 
 		 379 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  53.51 
 
 		 379 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1654  lipoprotein NlpD, putative  47.18 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>