115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0744 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  76.88 
 
 		 199 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  75.88 
 
 		 199 aa  314  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  75.88 
 
 		 199 aa  314  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  76.88 
 
 		 199 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  72 
 
 		 224 aa  309  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  72.2 
 
 		 205 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  73.37 
 
 		 205 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  72.86 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  72.36 
 
 		 205 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  68.34 
 
 		 205 aa  294  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  70.71 
 
 		 206 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  66.67 
 
 		 275 aa  274  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.33 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  62.98 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.87 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  33.69 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.2 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  32.62 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  32.62 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.45 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  32.62 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  32.62 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  32.62 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  32.09 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.69 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  31.55 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.09 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.62 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.44 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  30.59 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  29.14 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  29.05 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  28.57 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  28.57 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  27.32 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  28 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.67 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.98 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.26 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  26.26 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 321 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.5 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.53 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 345 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.16 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  28.98 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  27.56 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  29.14 
 
 		 343 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  27.03 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 319 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 343 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 349 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  26.16 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 347 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.16 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.16 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 344 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  28.16 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  29.55 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  30.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 361 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 334 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  22.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  30.83 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  22.73 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  27.81 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.43 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.08 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4813  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 325 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0342905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 316 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  25.85 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.79 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.38 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  28.57 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  27.75 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  25.56 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  25.29 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.29 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.29 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  33.63 
 
 		 325 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  24.43 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 341 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>