101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5950 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  100 
 
 
199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  98.99 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  85.86 
 
 
199 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  74.75 
 
 
205 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  70.85 
 
 
205 aa  309  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  71.86 
 
 
224 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  73.23 
 
 
205 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  72.73 
 
 
205 aa  306  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  72.73 
 
 
205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  71.57 
 
 
206 aa  297  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  75.88 
 
 
210 aa  293  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.34 
 
 
204 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  61.19 
 
 
214 aa  257  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  62.12 
 
 
275 aa  256  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.88 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  36.56 
 
 
190 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  37.63 
 
 
190 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  36.56 
 
 
190 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.18 
 
 
200 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.18 
 
 
200 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  36.56 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.18 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  36.02 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  36.02 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  36.02 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  36.02 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
200 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  34.67 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  34.67 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.48 
 
 
190 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 
200 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.17 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  33.12 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.55 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.74 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.42 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  28.42 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  30.53 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  28.49 
 
 
245 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.49 
 
 
245 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.49 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.57 
 
 
199 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.72 
 
 
227 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  25.73 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  26.7 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  26.54 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  29.51 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.71 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  28.49 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  26.14 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  26.14 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  26.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  26.74 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  26.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  26.74 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  26.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  26.74 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.14 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  25.57 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
317 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.51 
 
 
276 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  28.81 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  27.33 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  30 
 
 
691 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  33.77 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  25.29 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  30.51 
 
 
242 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.71 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 
332 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.49 
 
 
241 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  29.02 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  27.59 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  24.63 
 
 
238 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.98 
 
 
225 aa  45.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.51 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  33.33 
 
 
332 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 
332 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  29.61 
 
 
347 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.13 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  26.67 
 
 
310 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.61 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  26.74 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  27.65 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  28.16 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.16 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 
343 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.16 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  28.82 
 
 
229 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  24.56 
 
 
228 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 
343 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  26.86 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  24.56 
 
 
228 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
344 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 
344 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.14 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  22.6 
 
 
183 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  28.07 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>