143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5295 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.9 
 
 
200 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.38 
 
 
200 aa  228  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.38 
 
 
200 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.9 
 
 
200 aa  228  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  55.9 
 
 
200 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.9 
 
 
200 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.9 
 
 
200 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  55.38 
 
 
200 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.87 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.44 
 
 
217 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  49.72 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  41.08 
 
 
190 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  39.46 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  39.46 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.46 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  39.46 
 
 
190 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  39.46 
 
 
190 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  40.54 
 
 
190 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  38.92 
 
 
190 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  39.46 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  36.7 
 
 
214 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.46 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  35.14 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  37.84 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  36.56 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  37.3 
 
 
205 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  34.59 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  36.76 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.76 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  36.76 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  37.31 
 
 
275 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.68 
 
 
205 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  36.32 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.74 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  33.67 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  30.68 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  30.81 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  42.31 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
323 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  27.49 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  29.05 
 
 
361 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
338 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  31.06 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  31.06 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 
314 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  28.89 
 
 
331 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  31.79 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
317 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
329 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
336 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.08 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.71 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  28.4 
 
 
324 aa  48.5  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 
317 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 
327 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  26.92 
 
 
349 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  26.23 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  29.3 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  25.76 
 
 
183 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 
338 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  26.14 
 
 
321 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  22.97 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  28.65 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
338 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
332 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 
320 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
332 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.79 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.6 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.07 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  33.09 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 
321 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 
320 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.26 
 
 
188 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.2 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  28.82 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 
327 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  28.76 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.31 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  38.54 
 
 
333 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  23.21 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  27.97 
 
 
333 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  24.29 
 
 
344 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  28.98 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  40 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  27.93 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
345 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 
346 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.56 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>