210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1523 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96 
 
 
200 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.5 
 
 
200 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  94.5 
 
 
200 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  94 
 
 
200 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  91.5 
 
 
200 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91 
 
 
200 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  90.5 
 
 
200 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  90.5 
 
 
200 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.66 
 
 
217 aa  258  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  67.17 
 
 
204 aa  254  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 
221 aa  227  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  36.36 
 
 
190 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  36.36 
 
 
190 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  37.43 
 
 
190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  35.83 
 
 
190 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  35.83 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  36.9 
 
 
190 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  35.29 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  36.36 
 
 
190 aa  130  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  36.65 
 
 
214 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  34.41 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 
190 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  37.97 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  37.97 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  37.43 
 
 
224 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  36.7 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  37.43 
 
 
205 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  34.67 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.1 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.17 
 
 
199 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  37.58 
 
 
275 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.77 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  35.98 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.58 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  35.29 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  30 
 
 
297 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  30.17 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  34.78 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
285 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.96 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  28.96 
 
 
245 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.96 
 
 
245 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.43 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
332 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
316 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 
321 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.63 
 
 
246 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  27.75 
 
 
333 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.93 
 
 
226 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  29.61 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  24.06 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  24.16 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  24.16 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  30.43 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  30.85 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.25 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 
332 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.43 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  26.52 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
314 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  24.58 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  23.75 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  27.27 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
349 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  22.4 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.67 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 
323 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  23.08 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 
335 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
342 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
311 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  30.91 
 
 
331 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  26.49 
 
 
224 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  29.2 
 
 
241 aa  48.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  25.13 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
313 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  21.86 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.08 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 
339 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  29.27 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  26.04 
 
 
316 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  27.52 
 
 
238 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
332 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.41 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  31.75 
 
 
334 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 
327 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  28.91 
 
 
328 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  24.73 
 
 
333 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.81 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  31.96 
 
 
330 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  26 
 
 
228 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  26 
 
 
228 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
336 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>