116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4238 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  100 
 
 
214 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.32 
 
 
209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  62.19 
 
 
205 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  61.69 
 
 
205 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  61.19 
 
 
205 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  62.19 
 
 
199 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.76 
 
 
204 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.62 
 
 
205 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  61.5 
 
 
206 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  60.59 
 
 
224 aa  257  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.19 
 
 
199 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  61.19 
 
 
199 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.19 
 
 
199 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  58.21 
 
 
205 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  62.98 
 
 
210 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  55.45 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.19 
 
 
200 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.82 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.68 
 
 
200 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  36.65 
 
 
200 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  35.68 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.31 
 
 
200 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.31 
 
 
200 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.45 
 
 
200 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.13 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  32.8 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  32.8 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.87 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  32.8 
 
 
190 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  32.8 
 
 
190 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  32.26 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  32.8 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  30.86 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.21 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.66 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  28.98 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  27.37 
 
 
205 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  27.96 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.99 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  25.99 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  25.99 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  26.55 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.56 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  25.42 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.78 
 
 
227 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  27.75 
 
 
211 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.11 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  24.44 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  28.89 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.37 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.14 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  24.87 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  24.56 
 
 
361 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.56 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.58 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  24.57 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.57 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  21.2 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.91 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  27.16 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  27.96 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  25.54 
 
 
198 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  25 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.91 
 
 
246 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
209 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  25.57 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5406  ThiJ/PfpI domain protein  25.51 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.63 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
335 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 
198 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.6 
 
 
226 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.44 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
401 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  21.43 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.64 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  24.18 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  27.94 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  23.12 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  24.86 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  25 
 
 
349 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
338 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  26.4 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  26.06 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.06 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.06 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.04 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  23.98 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  24.04 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  27.82 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  26.06 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  26.06 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  26.06 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  25.17 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001039  transcriptional regulator  26.34 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.64 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 
317 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>