189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2404 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  98.5 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  96.5 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.5 
 
 		 200 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  91 
 
 		 200 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91 
 
 		 200 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91.5 
 
 		 200 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91 
 
 		 200 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89.5 
 
 		 200 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.15 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  66.16 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  35.79 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  35.79 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  36.84 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  35.26 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  36.84 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  35.26 
 
 		 190 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  35.79 
 
 		 190 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  34.74 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  35.68 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.74 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  36.59 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  36.84 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.36 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  34.17 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.17 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.63 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  34.95 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  34.95 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  34.41 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  35.45 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  35.76 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  34.39 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.58 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  34.69 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  34.78 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  30 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.22 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  28.82 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  27.96 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  26.67 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  26.67 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  25.56 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  23.23 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.29 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  23.23 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  25.13 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 321 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.34 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  28.26 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.26 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.26 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 317 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.36 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  24.44 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 339 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  29.35 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 323 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.07 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 310 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.18 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.4 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 349 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 342 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 327 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  30.09 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  30.89 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  29.38 
 
 		 350 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  23.4 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.38 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 319 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  28.72 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.84 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  23.66 
 
 		 329 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.41 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.44 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 316 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  34.41 
 
 		 345 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 334 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  21.98 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>