173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2106 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  79.29 
 
 
205 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  79.29 
 
 
205 aa  327  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  78.79 
 
 
205 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  76.88 
 
 
224 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  76.77 
 
 
205 aa  318  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  76.5 
 
 
206 aa  315  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  73.23 
 
 
199 aa  313  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  70.85 
 
 
199 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.85 
 
 
199 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.35 
 
 
199 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.35 
 
 
204 aa  298  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  68.34 
 
 
210 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  59 
 
 
275 aa  254  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  58.21 
 
 
214 aa  252  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.11 
 
 
209 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.8 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.8 
 
 
200 aa  124  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.2 
 
 
200 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  34.41 
 
 
200 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.95 
 
 
200 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.41 
 
 
200 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  37.2 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.59 
 
 
200 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  34.95 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  34.95 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  34.95 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  34.95 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  34.95 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  34.41 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  34.41 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  33.87 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  32.34 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.76 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.41 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.49 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  27.32 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.32 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
321 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  26.35 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.35 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.35 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  25.29 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  30 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  29.69 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  25.57 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  25.87 
 
 
198 aa  52  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  25 
 
 
199 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  29.73 
 
 
199 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  26.82 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  26.86 
 
 
203 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
345 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.52 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.56 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  26.16 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  25.14 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.14 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  29.34 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  30.65 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  26.16 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.14 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  26.16 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  26.16 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  26.16 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  26.16 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.32 
 
 
361 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  28.99 
 
 
319 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.73 
 
 
199 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  23.37 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.07 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  23.37 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  24.86 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 
332 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  23.37 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  26 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  25.88 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.08 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.09 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
334 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2917  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
333 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  21.98 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.76 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  25.46 
 
 
227 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  25.58 
 
 
691 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.7 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 
314 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  23.57 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  26.42 
 
 
241 aa  45.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.59 
 
 
349 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.54 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  26.16 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  28.81 
 
 
331 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  31.71 
 
 
332 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 
321 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  26.92 
 
 
350 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.9 
 
 
231 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>