59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4681 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.82 
 
 		 205 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  63.11 
 
 		 205 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  63.11 
 
 		 205 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.13 
 
 		 199 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  62.25 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  60.66 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  62.62 
 
 		 205 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.12 
 
 		 199 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  62.12 
 
 		 199 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  59 
 
 		 205 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  61.62 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  66.67 
 
 		 210 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.11 
 
 		 204 aa  244  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  55.45 
 
 		 214 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  58.91 
 
 		 209 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  37.58 
 
 		 200 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  34.95 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  36.97 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  34.95 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  35.48 
 
 		 190 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  34.95 
 
 		 190 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  34.95 
 
 		 190 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 200 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 200 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  34.41 
 
 		 190 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  34.41 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  36.65 
 
 		 190 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 200 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 221 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.76 
 
 		 200 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.74 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.55 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.55 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.94 
 
 		 200 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.19 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  31.34 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  30.86 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  26.7 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  28.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  25.75 
 
 		 211 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 		 199 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  25.68 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  25.53 
 
 		 199 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  25.53 
 
 		 199 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.37 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  29.32 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  28.96 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  80.77 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.7 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  27.87 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.44 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.44 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  24.57 
 
 		 179 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  21.91 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.71 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>