210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2856 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  79.9 
 
 		 204 aa  309  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.68 
 
 		 200 aa  290  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.17 
 
 		 200 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.17 
 
 		 200 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  65.66 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  65.66 
 
 		 200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.66 
 
 		 200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.65 
 
 		 200 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.15 
 
 		 200 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.66 
 
 		 200 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  37.63 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  37.63 
 
 		 190 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  37.63 
 
 		 190 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  37.1 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  37.1 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  36.56 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  36.56 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  35.48 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.48 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  32.97 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  31.89 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  32.97 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  32.43 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  30.32 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.6 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  31.38 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  32.24 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.24 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  31.55 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.69 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.55 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  30.65 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  31.52 
 
 		 275 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  33.87 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  31.13 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  31.84 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  25.33 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  25.33 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  36.96 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  26.37 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  27.89 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  31.75 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.83 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  27.5 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.09 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.72 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.27 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  25.11 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  24.59 
 
 		 691 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  24.59 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  24.59 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  24.59 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  30.7 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  26.52 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  24.59 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  24.59 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  24.59 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  28.04 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  24 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.68 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.12 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 314 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.05 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  26.56 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  25.32 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  31.53 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  29.77 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  25.15 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.52 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  26.82 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.82 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  24.5 
 
 		 180 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  24.72 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  23.83 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  24.72 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  23.5 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  31.25 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 313 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.82 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  25.17 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 326 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  28.04 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  24.43 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.43 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>