225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1710 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  407  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96.5 
 
 
200 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96 
 
 
200 aa  393  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  94.5 
 
 
200 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.5 
 
 
200 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  92 
 
 
200 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91.5 
 
 
200 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91 
 
 
200 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91 
 
 
200 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.68 
 
 
217 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  68.18 
 
 
204 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  55.9 
 
 
221 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  37.1 
 
 
190 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  37.1 
 
 
190 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  38.17 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  36.56 
 
 
190 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  36.56 
 
 
190 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  36.02 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  37.1 
 
 
190 aa  131  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  36.56 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.48 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  37.8 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  36.45 
 
 
214 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  37.23 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  35.18 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.18 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  37.97 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  37.97 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  37.43 
 
 
224 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  37.43 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.81 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  35.45 
 
 
206 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.02 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  36.36 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.06 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  34.76 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  31.15 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  35.87 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
285 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  28.33 
 
 
297 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  30.05 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.05 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.05 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.22 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
321 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  23.87 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  23.87 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.17 
 
 
246 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  26.67 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  26.67 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.64 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 
332 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  26.67 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  26.67 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  25.56 
 
 
199 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 
311 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.93 
 
 
226 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  30 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  23.5 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  30.83 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.54 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  26.79 
 
 
333 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
316 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  33.73 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  25.82 
 
 
349 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
349 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.41 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  24.66 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  25 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  29.79 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  26.45 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  30.06 
 
 
239 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  24.44 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
314 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 
327 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  29.2 
 
 
241 aa  48.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
321 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  28.11 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.41 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  25.13 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  22.4 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
313 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  30.08 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.97 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 
388 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  28.97 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.11 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  28.99 
 
 
319 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.31 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.41 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
332 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  25.97 
 
 
220 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  29.13 
 
 
232 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  30.07 
 
 
212 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 
335 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>