276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05611 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  79.9 
 
 		 217 aa  309  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.18 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.68 
 
 		 200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.68 
 
 		 200 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  67.17 
 
 		 200 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.17 
 
 		 200 aa  277  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  66.67 
 
 		 200 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.16 
 
 		 200 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.16 
 
 		 200 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.16 
 
 		 200 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  38.1 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  38.1 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  37.57 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  37.57 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  37.04 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  36.51 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  37.04 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  35.45 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.92 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  31.35 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.81 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  31.05 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  29.9 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  29.9 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  31.89 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.89 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  29.38 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.35 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.35 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  29.95 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  28.43 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  29.57 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  30.25 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  30.26 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  30.34 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  30.16 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  28 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.9 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  27.66 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  27.74 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  26.84 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  24.67 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  24.67 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  28.65 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.4 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.38 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  27.38 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.38 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  27.46 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  30.33 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.86 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.75 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.8 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  24.7 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  25.62 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 332 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  32 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  24.85 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.05 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  25.56 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  25.57 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 321 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.43 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.53 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.82 
 
 		 324 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  25.83 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 326 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  24.67 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  24.67 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.26 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  24.86 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.7 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.95 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  24.86 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  26.78 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.14 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  26.14 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  24.02 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.14 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.54 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  23.3 
 
 		 691 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  29.68 
 
 		 363 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 333 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  24.86 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  24.48 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.69 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.46 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 332 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.85 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  31.17 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5070  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>