238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1887 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  97 
 
 		 200 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  96.5 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  91.5 
 
 		 200 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  92 
 
 		 200 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  92 
 
 		 200 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91.5 
 
 		 200 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  90 
 
 		 200 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.66 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  66.67 
 
 		 204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  36.84 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  36.84 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  37.89 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  37.89 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  36.32 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  36.32 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  35.79 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  36.32 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.26 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  35.68 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  37.89 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  37.2 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  36.9 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.18 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  36.9 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  34.67 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.81 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  36.97 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.02 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  35.45 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  34.92 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.58 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  35.2 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  34.78 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  31.67 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  29.51 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.51 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.86 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.12 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  23.87 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.43 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  23.87 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  31.86 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 321 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 314 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  26.29 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 331 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  26.29 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.07 
 
 		 246 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  23.63 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  27.42 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.97 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 314 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  25.14 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.43 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  29.85 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.07 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  31.71 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 349 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  24.66 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.46 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  30.64 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  24.58 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 358 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  35.21 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 339 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  26.45 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  29.65 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 349 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 327 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 334 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 388 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 342 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  29.13 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 344 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 361 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 313 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 336 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.97 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  24 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  24.86 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.41 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  28.37 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 344 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 344 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  24.12 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>