205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2854 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  97.5 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  98 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.5 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  94 
 
 		 200 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  90 
 
 		 200 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89.5 
 
 		 200 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89 
 
 		 200 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89 
 
 		 200 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.66 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  66.16 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  35.29 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  36.36 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  35.29 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  34.76 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  34.76 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  34.22 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  35.29 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  34.76 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  36.13 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.69 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  37.43 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  37.43 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  35.5 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  36.9 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  36.7 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  34.92 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.64 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.17 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  33.94 
 
 		 275 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  32.62 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  34.78 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  30.6 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  27.75 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.39 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  24.67 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  24.67 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  29.67 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.61 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.67 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  30.68 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 311 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.09 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.49 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 332 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.63 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  25.77 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  30.08 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  25.81 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  25.81 
 
 		 333 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  30.85 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.66 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 349 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  30.89 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.44 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 		 249 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  26.6 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  22.7 
 
 		 329 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.11 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  26.27 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  23.15 
 
 		 326 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 314 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  29.71 
 
 		 314 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.43 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  22.53 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  29.2 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 356 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  23.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.83 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  24.1 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 339 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  31.03 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  25 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  27.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  24.62 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 349 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  34.41 
 
 		 345 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 344 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 332 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  25.27 
 
 		 333 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 344 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 344 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>