126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1515 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1515  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156779  normal  0.419561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2106  ThiJ/PfpI domain protein  70.35 
 
 		 205 aa  298  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2040  DJ-1/PfpI family protein  74.37 
 
 		 224 aa  295  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0609  DJ-1/PfpI family protein  70.71 
 
 		 205 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2002  DJ-1/PfpI family protein  70.71 
 
 		 205 aa  287  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1966  DJ-1/PfpI family protein, putative  71.57 
 
 		 206 aa  287  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5570  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.5 
 
 		 205 aa  287  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7256  ThiJ/PfpI family protein  68.69 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0702  DJ-1/PfpI family protein  70.2 
 
 		 205 aa  285  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5586  ThiJ/PfpI  67.34 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5950  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.34 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6451  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.34 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4238  DJ-1/PfpI family protein  61.76 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0744  ThiJ/PfpI domain protein  65.33 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4681  hypothetical protein  61.11 
 
 		 275 aa  244  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4745  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.02 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.91 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0493848  normal  0.0496255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1664  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.36 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5295  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2404  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.36 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1523  ThiJ/PfpI domain protein  37.1 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1887  hypothetical protein  36.81 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.81 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2836  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.02 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.02 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2473  thiJ/pfpI family protein  31.72 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00161724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2437  ThiJ/PfpI family protein  31.72 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2399  thiJ/PfpI family protein  31.72 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.035922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2654  thiJ/pfpI family protein  31.72 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2854  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.64 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2688  thiJ/pfpI family protein  32.26 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0123402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2672  thiJ/pfpI family protein  31.18 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2727  thiJ/pfpI family protein  32.26 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0537702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2057  thiJ/pfpI family protein  31.72 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2372  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.65 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05611  hypothetical protein  31.18 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2856  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.64 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.06 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.87 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  29.48 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.48 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.7 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.7 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  29.63 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.29 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  25 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.14 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  27.33 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  26.14 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  28 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  27.57 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  28.47 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.86 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  24.58 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.78 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  27.78 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  24.04 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  24.43 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  26.94 
 
 		 361 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  24.43 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 349 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 298 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.68 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  23.97 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  28.09 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.09 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  28.65 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.09 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  28.65 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  29.33 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.17 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  25.43 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 334 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 332 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  30.58 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  29.13 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  26.18 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  22.53 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  25 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  26.6 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  29.48 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  26.59 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 345 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  24.43 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  26.49 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.48 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  26.92 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.63 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.43 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.5 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  31.93 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.67 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 331 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>