More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001039 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001039  transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  67 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 349 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.44 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  32.45 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  32.65 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.96 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.84 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  29.47 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  30.54 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  31.09 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.86 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  29.5 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  27.66 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  29.5 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  29.5 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  29.5 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.8 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.23 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  29.5 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  29.5 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  29.53 
 
 		 691 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 		 338 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  26.9 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.17 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.69 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  31.63 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.79 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  29.26 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.63 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  25.64 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  30.41 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  27.92 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.46 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.69 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  27.66 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  28.5 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  30.37 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  29.5 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  28.98 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  27.23 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  27.23 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  30.88 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.4 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.4 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 319 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  29.79 
 
 		 328 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  27.5 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.5 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.5 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 312 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.3 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  30.85 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  27.36 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>