More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1790 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  77.42 
 
 		 406 aa  649    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  79.26 
 
 		 406 aa  676    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 407 aa  825    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  90.42 
 
 		 407 aa  766    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  46.17 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  46.74 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  46.34 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  44.16 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  45.18 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  45.18 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  43.91 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  40.53 
 
 		 378 aa  292  9e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.49 
 
 		 441 aa  222  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  33.97 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.85 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.21 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.64 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.05 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  32.64 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.39 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.59 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  34.3 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  34.54 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.33 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.07 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.89 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.81 
 
 		 390 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.55 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.94 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  32.64 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 		 392 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.47 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  34.91 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.5 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.03 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  32.38 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.85 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  32.81 
 
 		 794 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.06 
 
 		 359 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.46 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  32.64 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  32.98 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  31.37 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  32.45 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  32.9 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  31.43 
 
 		 580 aa  199  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.23 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.61 
 
 		 359 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  32.31 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  32.61 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  33.17 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  32.14 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  32.35 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.52 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.11 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  33.17 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.96 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.38 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.85 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 		 420 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.47 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  32.11 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  32.11 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  32.37 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.27 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  31.63 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.82 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  31.93 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.05 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  31.35 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  32.04 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.7 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.31 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  31.87 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  31.97 
 
 		 793 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.03 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  31.19 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.74 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  32.73 
 
 		 416 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  32.2 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.28 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  31.66 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  31.03 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  31.23 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.56 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  32.05 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  30.61 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  32.84 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  31.94 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.87 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.01 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>