More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1662 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 383 aa  785    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.49 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.04 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.04 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.52 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.3 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.3 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.6 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.51 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.13 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  47.07 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.66 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  46.39 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  45.91 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  49.1 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  45.67 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.78 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  46.15 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  46.15 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  48.7 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  44.71 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  44.36 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  49.87 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  44.29 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  44.66 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.04 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  44.36 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.19 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  44.52 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  44.82 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  43.91 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.68 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  48.07 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.55 
 
 		 422 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  44.52 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  48.45 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  44.52 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  48.45 
 
 		 408 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.04 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  44.25 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  44.52 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  44.52 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  44.52 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  44.05 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  44.05 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  45.91 
 
 		 417 aa  361  9e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  44.88 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  45.91 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  43.77 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  43.17 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  43.9 
 
 		 417 aa  359  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  43.77 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  43.37 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.02 
 
 		 441 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  43.37 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  47.04 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  47.18 
 
 		 408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  47.29 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  43.13 
 
 		 435 aa  355  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  46.79 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.42 
 
 		 580 aa  350  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  42.31 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  42.48 
 
 		 417 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  42.3 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  45.41 
 
 		 401 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.78 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.79 
 
 		 571 aa  344  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  44.22 
 
 		 393 aa  343  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  45.57 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  45.55 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.31 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  43.7 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  41.73 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 402 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>