More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0483 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 426 aa  873    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  62.11 
 
 		 414 aa  501  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.73 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.19 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.93 
 
 		 390 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.95 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.95 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.95 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.75 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.61 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.6 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.97 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.7 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  49.61 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  47.12 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  46.63 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.81 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  46.87 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  48.57 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.59 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  46.63 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  47.42 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  46.65 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  47.1 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  46.15 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  47.16 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  47.16 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  47.24 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.26 
 
 		 793 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  47.97 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.79 
 
 		 794 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  45.19 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.45 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.09 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  46.39 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  47.92 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  46.63 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  46.12 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.88 
 
 		 787 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.08 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  47.8 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.67 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  46.23 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  46.65 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  47.21 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.26 
 
 		 791 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  47.8 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2862  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.46 
 
 		 598 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260803  hitchhiker  0.00720367 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  47.52 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  47.8 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  46.65 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.15 
 
 		 441 aa  368  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  45.82 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  47.14 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  46.36 
 
 		 417 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.52 
 
 		 792 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.74 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3367  NADH dehydrogenase I, C/D subunit  43.93 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.812668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.34 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  45.39 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  45.87 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.74 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.94 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  45.43 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.83 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  46.79 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  46.7 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  46.91 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  47.66 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  45.43 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  45.63 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  46.39 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.88 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.46 
 
 		 594 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.39 
 
 		 593 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  45.19 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.88 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>