More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0141 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  72.57 
 
 		 412 aa  641    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 408 aa  848    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  72.06 
 
 		 408 aa  632  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  70.83 
 
 		 408 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  70.83 
 
 		 408 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  70.59 
 
 		 408 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  65.6 
 
 		 409 aa  596  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  64.95 
 
 		 408 aa  593  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.64 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.55 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  47.43 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.51 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.29 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.59 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  46.94 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.67 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.67 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.99 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  46.94 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  46.7 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  48.17 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  46.83 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.03 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  46.72 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  47.36 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  46.59 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  47.56 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  47.56 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  45.78 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  45.85 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  46.83 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  45.85 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  46.47 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  45.37 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.97 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  46.59 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  45.78 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  46.85 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  45.06 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.45 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  44.88 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  45.23 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.48 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  45.43 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  47.07 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  46.91 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  46.34 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  47.3 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.82 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.06 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.04 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  43.17 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  47.42 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.22 
 
 		 411 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  46.68 
 
 		 475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  45.85 
 
 		 424 aa  362  7.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 435 aa  362  8e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 435 aa  362  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  45.37 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  47.41 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  47.53 
 
 		 403 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.42 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  42.69 
 
 		 436 aa  359  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.08 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  44.61 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  43.26 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  43.26 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  46.13 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>