More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1208 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 367 aa  758    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  71.31 
 
 		 366 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  60.27 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  56.56 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  56.28 
 
 		 367 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  56.56 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.46 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  53.83 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  55.46 
 
 		 366 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.55 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  53.01 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  53.01 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  52.46 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.73 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  50 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  50 
 
 		 389 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.85 
 
 		 390 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  52.01 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  52.89 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.45 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.84 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  51.21 
 
 		 374 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  50.95 
 
 		 370 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.85 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.46 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  50.69 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.99 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  48.78 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.66 
 
 		 426 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.99 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 		 397 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  42.55 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  42.79 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.39 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  42.31 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  42.55 
 
 		 417 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  42.79 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  42.79 
 
 		 417 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  41.35 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  41.35 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  42.31 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  42.31 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  47.97 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.97 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  47.97 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.9 
 
 		 417 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  43.96 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  42.72 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.62 
 
 		 792 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.52 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  41.5 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  45.13 
 
 		 402 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.39 
 
 		 417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>