More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4983 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
370 aa  764    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  73.53 
 
 
374 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  74.59 
 
 
369 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  72.99 
 
 
374 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  57.18 
 
 
367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  57.18 
 
 
367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.83 
 
 
367 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  50.95 
 
 
367 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  51.09 
 
 
366 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  49.86 
 
 
371 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.8 
 
 
390 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.68 
 
 
400 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  46.34 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  46.34 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  46.34 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  46.34 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.76 
 
 
390 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.82 
 
 
414 aa  354  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  45.8 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 
366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  48.24 
 
 
366 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.01 
 
 
390 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.62 
 
 
389 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.62 
 
 
389 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.78 
 
 
390 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 
417 aa  348  6e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 
417 aa  348  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.52 
 
 
404 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.63 
 
 
417 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 
417 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.33 
 
 
415 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.21 
 
 
401 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 
370 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 
417 aa  345  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  46.88 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.47 
 
 
373 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 
417 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.11 
 
 
417 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 
417 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 
417 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 
417 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 
417 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 
417 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.64 
 
 
411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  338  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 
397 aa  338  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 
417 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
417 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.39 
 
 
417 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 
417 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.8 
 
 
381 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.87 
 
 
417 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  45.17 
 
 
406 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  44.84 
 
 
406 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  44.1 
 
 
403 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.85 
 
 
426 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  42.44 
 
 
435 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  42.68 
 
 
435 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 
417 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 
417 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  42.44 
 
 
435 aa  332  6e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.79 
 
 
388 aa  332  6e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.56 
 
 
393 aa  332  6e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
417 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  43.59 
 
 
412 aa  332  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.11 
 
 
417 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 
417 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 
417 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  45.05 
 
 
403 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.33 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.27 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  41.87 
 
 
417 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>