More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3298 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  85.25 
 
 
366 aa  660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  84.15 
 
 
366 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  85.79 
 
 
366 aa  664    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  85.25 
 
 
366 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  84.97 
 
 
366 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  85.79 
 
 
366 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  84.7 
 
 
366 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  85.79 
 
 
366 aa  664    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  85.52 
 
 
366 aa  661    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  85.52 
 
 
366 aa  662    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  85.25 
 
 
366 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 
366 aa  752    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  92.9 
 
 
367 aa  710    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  55.89 
 
 
366 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  55.46 
 
 
367 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.08 
 
 
400 aa  388  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  52.05 
 
 
367 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  51.78 
 
 
367 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.45 
 
 
401 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
406 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.96 
 
 
367 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.18 
 
 
404 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  51.1 
 
 
371 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  51.08 
 
 
395 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  51.34 
 
 
395 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  49.19 
 
 
400 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  48.84 
 
 
394 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.85 
 
 
381 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.93 
 
 
417 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  47.29 
 
 
394 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.41 
 
 
390 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  47.55 
 
 
394 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.41 
 
 
411 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  48.21 
 
 
373 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  47.29 
 
 
394 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  47.29 
 
 
394 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  49.73 
 
 
400 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  49.19 
 
 
400 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  48.32 
 
 
394 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  47.8 
 
 
394 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.51 
 
 
394 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.65 
 
 
422 aa  362  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.77 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.91 
 
 
395 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.91 
 
 
395 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  48.32 
 
 
394 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.51 
 
 
394 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.91 
 
 
395 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  48.32 
 
 
394 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  46.65 
 
 
395 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.62 
 
 
390 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  47.8 
 
 
394 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  46.11 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.83 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  49.46 
 
 
400 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  46.92 
 
 
374 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 
389 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  48.92 
 
 
400 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 
389 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 
408 aa  352  7e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  48.9 
 
 
370 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  45.19 
 
 
408 aa  352  8.999999999999999e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 
370 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  48.04 
 
 
358 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  44.3 
 
 
408 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.42 
 
 
408 aa  349  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  46.38 
 
 
374 aa  348  7e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.59 
 
 
390 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 
409 aa  345  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.74 
 
 
394 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  45.36 
 
 
385 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  46.13 
 
 
399 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.29 
 
 
794 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  46.47 
 
 
379 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  46.47 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 
417 aa  339  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.01 
 
 
426 aa  339  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.47 
 
 
379 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.04 
 
 
793 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.38 
 
 
792 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.07 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.26 
 
 
608 aa  335  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.64 
 
 
791 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.1 
 
 
413 aa  334  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.42 
 
 
441 aa  333  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  46.3 
 
 
392 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  41.28 
 
 
580 aa  331  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.86 
 
 
414 aa  331  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
412 aa  331  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 
381 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  43.57 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
405 aa  328  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.49 
 
 
587 aa  328  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  43.99 
 
 
398 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  42.04 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.36 
 
 
383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  43.99 
 
 
392 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.76 
 
 
414 aa  326  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>