More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1289 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 381 aa  782    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.17 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.39 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.59 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.39 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.66 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.67 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.41 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  53.17 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  52.73 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  53.3 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  52.6 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  52.6 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.23 
 
 		 367 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.84 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  49.73 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  48.49 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  50 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  48.34 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.76 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.81 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  47.67 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  47.4 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  47.4 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  47.4 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.39 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  48.22 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.48 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.14 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  45.68 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  44.91 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  45.68 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  46.23 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  46.85 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.04 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  45.68 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.38 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.63 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.79 
 
 		 792 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  45.36 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  43.77 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.53 
 
 		 793 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.4 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  45.55 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  43.9 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  43.9 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  44.8 
 
 		 460 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  43.9 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  43.9 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.58 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.58 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 435 aa  362  4e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.61 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.77 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.02 
 
 		 791 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  43.66 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  43.17 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  47 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.72 
 
 		 586 aa  358  9e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  43.91 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  44.07 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  43.28 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.99 
 
 		 794 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  43.17 
 
 		 417 aa  355  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>