More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2043 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 366 aa  746    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  71.31 
 
 		 367 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  60.16 
 
 		 371 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  56.99 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  56.71 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  56.99 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  56.44 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  56.99 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  56.44 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  56.44 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  56.44 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  56.44 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  56.44 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  56.83 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  55.86 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  55.07 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  55.89 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.28 
 
 		 367 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  56.01 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  56.79 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.17 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.54 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.48 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.48 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.84 
 
 		 401 aa  391  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.61 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.5 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.49 
 
 		 411 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.32 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  51.09 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.69 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  50.96 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  50.27 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  50.27 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.68 
 
 		 417 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  49.46 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  50.4 
 
 		 400 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.18 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.87 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  47.7 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  44.68 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  49.19 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.62 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  43.41 
 
 		 475 aa  358  7e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  48.39 
 
 		 400 aa  358  7e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  46.11 
 
 		 587 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.13 
 
 		 793 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  42.93 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.41 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.85 
 
 		 608 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  48.79 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.64 
 
 		 415 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.66 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.88 
 
 		 792 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  42.2 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.78 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 		 417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  46.34 
 
 		 593 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.75 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.48 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.48 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.99 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  48.39 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.48 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.48 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.36 
 
 		 791 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.78 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.75 
 
 		 417 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.99 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.7 
 
 		 593 aa  349  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.5 
 
 		 417 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  41.5 
 
 		 417 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 		 417 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  43.67 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.22 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  41.95 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  41.06 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.52 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  346  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.1 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.1 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.19 
 
 		 580 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.94 
 
 		 417 aa  346  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.1 
 
 		 394 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.36 
 
 		 394 aa  345  5e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.1 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  40.53 
 
 		 417 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 		 417 aa  345  6e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  45.31 
 
 		 408 aa  345  7e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  41.41 
 
 		 452 aa  344  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>