More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1604 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
400 aa  821    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  82.74 
 
 
395 aa  688    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  79.75 
 
 
400 aa  669    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  86.75 
 
 
400 aa  729    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  80.5 
 
 
400 aa  668    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  82.99 
 
 
395 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  81.25 
 
 
400 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  59.84 
 
 
405 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  59.89 
 
 
406 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  56.84 
 
 
392 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  54.47 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  48.43 
 
 
379 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  48.17 
 
 
379 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  48.17 
 
 
379 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  47.85 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  47.85 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  47.85 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  49.46 
 
 
366 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  48.12 
 
 
366 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  47.85 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  49.73 
 
 
367 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  48.79 
 
 
366 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 
366 aa  352  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 
366 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 
366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  46.77 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.41 
 
 
381 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  44.84 
 
 
416 aa  346  5e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.79 
 
 
367 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  44.68 
 
 
381 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  46.79 
 
 
367 aa  342  7e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  46.52 
 
 
367 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.92 
 
 
369 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.42 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.06 
 
 
389 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.06 
 
 
389 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.34 
 
 
400 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  47.15 
 
 
560 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.42 
 
 
390 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.16 
 
 
390 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.41 
 
 
358 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.66 
 
 
401 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  42.74 
 
 
374 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  42.48 
 
 
374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  44.62 
 
 
367 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.6 
 
 
554 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 
406 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  45.01 
 
 
370 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  43.4 
 
 
394 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.16 
 
 
404 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.09 
 
 
373 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  45.28 
 
 
399 aa  315  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.14 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1115  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.19 
 
 
552 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  44.27 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  40.53 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  40.53 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  40.53 
 
 
408 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 
408 aa  311  9e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.02 
 
 
394 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.04 
 
 
422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.64 
 
 
390 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.92 
 
 
417 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  40.92 
 
 
409 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.51 
 
 
394 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.15 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  41.93 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.93 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  41.93 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.41 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1919  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  42.68 
 
 
560 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.52 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.13 
 
 
414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.51 
 
 
394 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
417 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  42.35 
 
 
396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  41.6 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.89 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.25 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.89 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.79 
 
 
397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.69 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  42.53 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0704  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.92 
 
 
559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  41.28 
 
 
393 aa  302  5.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  42.46 
 
 
402 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.29 
 
 
403 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  39.3 
 
 
452 aa  302  7.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  41.46 
 
 
460 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  41.54 
 
 
393 aa  301  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  41.04 
 
 
398 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.75 
 
 
586 aa  300  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  42.6 
 
 
401 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.82 
 
 
402 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 
408 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  42.05 
 
 
406 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  42.35 
 
 
396 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>