More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0964 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  91.33 
 
 		 395 aa  761    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  88.5 
 
 		 400 aa  734    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  89.11 
 
 		 395 aa  740    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  83.75 
 
 		 400 aa  699    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  81.25 
 
 		 400 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 		 400 aa  825    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  80.75 
 
 		 400 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  59.89 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  59.84 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  56.05 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  56.84 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  50.4 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.86 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  47.86 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 		 366 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  47.59 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  48.12 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  48.12 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  48.12 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  47.85 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  47.31 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  47.31 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.86 
 
 		 367 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  47.59 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  47.59 
 
 		 367 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  46.79 
 
 		 381 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.98 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.98 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.33 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.34 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.07 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.84 
 
 		 390 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.11 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.94 
 
 		 401 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 		 416 aa  335  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.12 
 
 		 374 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.34 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  45.38 
 
 		 374 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.61 
 
 		 560 aa  332  5e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  45.7 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  46.24 
 
 		 370 aa  325  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  44.03 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.6 
 
 		 554 aa  322  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.43 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.01 
 
 		 373 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.69 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  42.56 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.58 
 
 		 426 aa  319  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.97 
 
 		 404 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.95 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  43.72 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1919  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.74 
 
 		 560 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.85 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.69 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.78 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  42.71 
 
 		 396 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  42.56 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  43.95 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  43 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.53 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.93 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  44.15 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.07 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1115  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.45 
 
 		 552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  45.55 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  42.86 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  40.87 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.08 
 
 		 393 aa  312  5.999999999999999e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.36 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  42.38 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  42.38 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.53 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.54 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.46 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  43.04 
 
 		 416 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  44.78 
 
 		 394 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  43.29 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 		 417 aa  308  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.59 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  40.61 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  43.37 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  42.71 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  42.53 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  43.37 
 
 		 396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  42.78 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0704  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  42.86 
 
 		 559 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 		 460 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.37 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.53 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.56 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.58 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>