More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0746 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 399 aa  825    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  55.39 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.04 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  46.13 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  46.41 
 
 		 367 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.61 
 
 		 381 aa  333  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  44.2 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  43.21 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  43.21 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  43.21 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  43.21 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  42.56 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.33 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  44.04 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.82 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.82 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.56 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  46.09 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  45.28 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.42 
 
 		 367 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.01 
 
 		 400 aa  315  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.55 
 
 		 400 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.56 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.38 
 
 		 389 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.38 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  45.28 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  42.05 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  40.29 
 
 		 417 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  44.47 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.47 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.61 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  42.15 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  38.98 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  42.15 
 
 		 367 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.98 
 
 		 400 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.93 
 
 		 791 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.48 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.6 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  38.83 
 
 		 417 aa  298  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.01 
 
 		 593 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  39.08 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  38.13 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.9 
 
 		 792 aa  295  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  41.26 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  38.89 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  37.77 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  40.89 
 
 		 408 aa  293  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.36 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  38.59 
 
 		 417 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  42.2 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.12 
 
 		 793 aa  292  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  37.44 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  38.99 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.43 
 
 		 383 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  36.8 
 
 		 417 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  39.07 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  36.8 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  39.32 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  37.2 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  37.29 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  39.08 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  36.8 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>