More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0746 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  82.56 
 
 
400 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  88.61 
 
 
400 aa  736    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  82.74 
 
 
400 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 
395 aa  810    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  84.62 
 
 
400 aa  695    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  88.61 
 
 
395 aa  740    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  89.11 
 
 
400 aa  740    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  60.69 
 
 
406 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  60.63 
 
 
405 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  56.81 
 
 
392 aa  478  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  56.05 
 
 
403 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.91 
 
 
379 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  51.34 
 
 
366 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  47.64 
 
 
379 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  47.91 
 
 
379 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  49.46 
 
 
366 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  49.46 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  363  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  51.08 
 
 
367 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  48.92 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  49.46 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  48.92 
 
 
366 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  48.92 
 
 
366 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.33 
 
 
367 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  46.34 
 
 
381 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  47.33 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  47.33 
 
 
367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.59 
 
 
369 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.34 
 
 
389 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.92 
 
 
381 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.34 
 
 
389 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.69 
 
 
390 aa  348  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 
416 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  46.24 
 
 
367 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  45.38 
 
 
374 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.12 
 
 
374 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.94 
 
 
390 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  47.25 
 
 
560 aa  339  5e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.43 
 
 
401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.18 
 
 
390 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  47.04 
 
 
370 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.58 
 
 
426 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.08 
 
 
400 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.69 
 
 
390 aa  332  5e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.78 
 
 
358 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.6 
 
 
404 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.68 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.56 
 
 
422 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.01 
 
 
373 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  45.43 
 
 
394 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1115  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.5 
 
 
552 aa  325  9e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.29 
 
 
390 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.59 
 
 
393 aa  323  3e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46.11 
 
 
554 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  44.95 
 
 
370 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 
398 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.53 
 
 
414 aa  322  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  43.47 
 
 
396 aa  322  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.88 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.55 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  43.22 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  44.8 
 
 
371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.85 
 
 
393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  44.03 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.59 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1919  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46.17 
 
 
560 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.81 
 
 
403 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  45.82 
 
 
399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  45.04 
 
 
394 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.11 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  43.21 
 
 
401 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 
388 aa  318  2e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.54 
 
 
417 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.29 
 
 
417 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.67 
 
 
394 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.1 
 
 
402 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.67 
 
 
394 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.16 
 
 
394 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  41.46 
 
 
396 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  43.11 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  43.15 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  43.11 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.42 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.91 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  43.15 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  40.57 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 
402 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 
416 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  40.81 
 
 
418 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.84 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  42.56 
 
 
392 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  41.59 
 
 
417 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 
417 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>