More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0512 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  74.42 
 
 		 406 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  100 
 
 		 392 aa  806    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  74.62 
 
 		 405 aa  643    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  66.5 
 
 		 403 aa  585  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  56.81 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  56.84 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  57.63 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  56.05 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  57.11 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  56.67 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  56.84 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.11 
 
 		 369 aa  342  9e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  43.56 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  43.56 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.56 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  44.71 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  45.24 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  45.24 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  46.3 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  44.97 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  45.24 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  44.97 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  44.71 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  44.97 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  44.82 
 
 		 374 aa  328  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  44.56 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.78 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.53 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.64 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  44.24 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.9 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  45 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  45 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  44.74 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  45 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.48 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.49 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  41.5 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.52 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.5 
 
 		 426 aa  309  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.74 
 
 		 415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  41.88 
 
 		 396 aa  309  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.09 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.68 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.58 
 
 		 402 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  40.86 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  40.05 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  41.54 
 
 		 388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.28 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.04 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.92 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  40.86 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.42 
 
 		 394 aa  302  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.42 
 
 		 394 aa  302  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  40.95 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.51 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.48 
 
 		 390 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  42.61 
 
 		 560 aa  299  5e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  41.88 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  41.58 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.59 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  41.62 
 
 		 396 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  40.86 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.1 
 
 		 571 aa  298  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  41.37 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  41.37 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  39.75 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  39.8 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  39.59 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.43 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  40.45 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.49 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  40.61 
 
 		 396 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.19 
 
 		 417 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  41.81 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.06 
 
 		 396 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.39 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.64 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.15 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.77 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.64 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  42.63 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  40.95 
 
 		 396 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.64 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.64 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.89 
 
 		 394 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  38.61 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  40.36 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  40.36 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.35 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  39.09 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>