More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3733 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  79.46 
 
 		 406 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 405 aa  836    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  74.62 
 
 		 392 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  68.34 
 
 		 403 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  60.63 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  59.84 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  59.84 
 
 		 400 aa  485  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  58.53 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  59.06 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  59.32 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  57.48 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.3 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  45.91 
 
 		 366 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  46.03 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  46.03 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.77 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  44.71 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  45.77 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  45.77 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  45.77 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  43.55 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  45.6 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.6 
 
 		 374 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 366 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.1 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  43.77 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.88 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.47 
 
 		 389 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.22 
 
 		 389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  44.62 
 
 		 367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 		 390 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  44.09 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.34 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  43.42 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.51 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.97 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.22 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.22 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.62 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  44.84 
 
 		 394 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  43.39 
 
 		 367 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.95 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.18 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  43.98 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.1 
 
 		 411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.33 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.75 
 
 		 415 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.68 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.84 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  40.89 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  41.87 
 
 		 417 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.27 
 
 		 373 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.75 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.32 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  38.97 
 
 		 416 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  42.13 
 
 		 396 aa  299  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.8 
 
 		 560 aa  298  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.32 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.47 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.07 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  41.6 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.86 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.07 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.47 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  41.42 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.95 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  40.49 
 
 		 398 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.07 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  43.24 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  40.25 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  41.94 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  39.29 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.6 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.72 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.39 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  41 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  41.88 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.22 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.22 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1115  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.28 
 
 		 552 aa  292  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  41.62 
 
 		 396 aa  292  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.4 
 
 		 401 aa  292  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  41.62 
 
 		 396 aa  292  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.51 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.38 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.45 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  39.09 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.46 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  40.97 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>