More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0637 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  79.75 
 
 
400 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  83.33 
 
 
395 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  86.25 
 
 
400 aa  728    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  84.62 
 
 
395 aa  695    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  100 
 
 
400 aa  823    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  79.75 
 
 
400 aa  674    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  83.75 
 
 
400 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  57.54 
 
 
406 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  57.48 
 
 
405 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  56.67 
 
 
392 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  55.79 
 
 
403 aa  450  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  49.19 
 
 
366 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  46.77 
 
 
366 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  47.58 
 
 
367 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  48.39 
 
 
366 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 
379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  355  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.81 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.33 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  47.33 
 
 
367 aa  355  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 
366 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  47.33 
 
 
367 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  46.24 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  46.24 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  46.24 
 
 
366 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.79 
 
 
369 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.99 
 
 
560 aa  346  5e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.94 
 
 
390 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 
416 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.45 
 
 
390 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.33 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.43 
 
 
390 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.33 
 
 
389 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.77 
 
 
381 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  43.98 
 
 
381 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  44.06 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  43.8 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.36 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1115  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.63 
 
 
552 aa  334  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  45.16 
 
 
367 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.03 
 
 
554 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.83 
 
 
426 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.91 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.96 
 
 
358 aa  326  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.53 
 
 
390 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 
401 aa  325  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44 
 
 
400 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  44.67 
 
 
394 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.53 
 
 
422 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0704  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.21 
 
 
559 aa  322  8e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1919  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.95 
 
 
560 aa  322  8e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 
370 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  42.42 
 
 
390 aa  319  6e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.74 
 
 
373 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  42.29 
 
 
398 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  43.72 
 
 
396 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.48 
 
 
417 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.27 
 
 
394 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 
399 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 
392 aa  315  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.02 
 
 
394 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.02 
 
 
394 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  44.27 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  43.47 
 
 
402 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  41.79 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.91 
 
 
394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  44.27 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.24 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  43.29 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 
409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  42.67 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  42.09 
 
 
397 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  41.84 
 
 
408 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
406 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  42.46 
 
 
396 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  39.42 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  39.41 
 
 
408 aa  309  4e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  39.41 
 
 
408 aa  310  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  42.47 
 
 
401 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  41.22 
 
 
408 aa  309  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2344  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.49 
 
 
549 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.05 
 
 
393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.94 
 
 
414 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.58 
 
 
414 aa  308  8e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  42.75 
 
 
394 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  42.53 
 
 
416 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  42.03 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  43.51 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.62 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  40.62 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  39.41 
 
 
408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.42 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  41.39 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  41.39 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>