More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2091 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  81.82 
 
 		 369 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  98.13 
 
 		 374 aa  759    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 374 aa  767    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  72.99 
 
 		 370 aa  589  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  58.82 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  58.82 
 
 		 367 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  59.36 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  51.21 
 
 		 367 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  50.27 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  49.06 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.19 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.3 
 
 		 417 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.76 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  43.36 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  45.22 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.55 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.41 
 
 		 411 aa  355  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  45.04 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  45.04 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  43.91 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  45.04 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  43.91 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  45.69 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  44.26 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  43.91 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.78 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 		 417 aa  352  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  44 
 
 		 417 aa  352  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  44.87 
 
 		 417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  44.77 
 
 		 366 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 		 417 aa  352  8e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  44.24 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  43.7 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 417 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  43.54 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  44.98 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  45.01 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  42.48 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.29 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.76 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  46.38 
 
 		 366 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  44.42 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  43.44 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.16 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.06 
 
 		 415 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.26 
 
 		 381 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.27 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.85 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  46.36 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  46.44 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 401 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  42.72 
 
 		 417 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  42.72 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.59 
 
 		 389 aa  345  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 402 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  43.77 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.64 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  45.01 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  45.84 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  44.44 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.47 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  45.43 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.25 
 
 		 390 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.25 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.77 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>