More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1329 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1329  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 416 aa  855    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.72 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  44.84 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  44.88 
 
 		 400 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  45.97 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.72 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3733  NADH dehydrogenase (quinone)  43.55 
 
 		 405 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150314  normal  0.769724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.72 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.48 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  44.03 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  44.09 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  43.21 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  42.04 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  43.32 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  41.29 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 		 366 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  42.29 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  42.29 
 
 		 366 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.65 
 
 		 381 aa  316  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.57 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  42.04 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.1 
 
 		 390 aa  315  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.11 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0661  hypothetical protein  41.5 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.87 
 
 		 389 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.43 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.01 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  41.87 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  41.5 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  41.77 
 
 		 379 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.33 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.48 
 
 		 400 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.35 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.33 
 
 		 408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  43 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  42.82 
 
 		 367 aa  303  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.26 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  39.44 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.42 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  39.39 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  39 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.18 
 
 		 373 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  38.88 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  39.91 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  39.11 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  37.47 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  38.64 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  37.47 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  38.82 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  37.47 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  37.03 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  37.76 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  37.41 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  37.74 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  37.76 
 
 		 417 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 		 397 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  38.95 
 
 		 417 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  37.5 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.63 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  38.93 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.81 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  37.97 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  37.7 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  37.26 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  37.65 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.49 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  37.94 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  37.24 
 
 		 417 aa  288  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  37.24 
 
 		 417 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  38.72 
 
 		 417 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  39.16 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  39.16 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  38.48 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  38.72 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  37.94 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>