More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1442 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  87.25 
 
 		 408 aa  762    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  87.5 
 
 		 408 aa  765    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 408 aa  848    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  87.5 
 
 		 408 aa  766    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  72.06 
 
 		 408 aa  632  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  71.08 
 
 		 408 aa  629  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  68.55 
 
 		 409 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  65.05 
 
 		 412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.09 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.1 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.35 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.35 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.1 
 
 		 389 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.58 
 
 		 390 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.26 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  46.94 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  49.35 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  47.8 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.7 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.32 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  45.23 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  44.25 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  45.23 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  47.56 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  47.56 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  46.94 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  46.32 
 
 		 417 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  46.32 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.55 
 
 		 411 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  47.29 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  46.23 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  44.74 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  44.25 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  43.77 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.06 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  45.19 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.51 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.97 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  45.23 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.42 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  43.77 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.1 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46.8 
 
 		 586 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 383 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.37 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.99 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  46.09 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  43.28 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  43.17 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.19 
 
 		 791 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  43.52 
 
 		 435 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  47.67 
 
 		 475 aa  363  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  44.25 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  45.85 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 435 aa  362  9e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  44.79 
 
 		 416 aa  362  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 435 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  45.97 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.32 
 
 		 793 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.83 
 
 		 392 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  45.6 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.27 
 
 		 422 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.82 
 
 		 792 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  45.05 
 
 		 452 aa  358  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.05 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.89 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>