More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1048 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  81.06 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  75.54 
 
 		 417 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  83.21 
 
 		 417 aa  750    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 417 aa  870    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  73.38 
 
 		 417 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  72.9 
 
 		 417 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  72.9 
 
 		 417 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  79.38 
 
 		 417 aa  716    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  70.74 
 
 		 417 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  81.06 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  78.66 
 
 		 417 aa  711    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  83.21 
 
 		 417 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  81.06 
 
 		 417 aa  726    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  80.82 
 
 		 417 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  82.25 
 
 		 417 aa  736    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  74.34 
 
 		 417 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  81.77 
 
 		 417 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  731    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  71.22 
 
 		 424 aa  646    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  76.02 
 
 		 417 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  75.3 
 
 		 417 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  80.58 
 
 		 417 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  77.22 
 
 		 417 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  81.53 
 
 		 417 aa  730    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  71.22 
 
 		 417 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  75.78 
 
 		 417 aa  685    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  80.58 
 
 		 417 aa  722    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  78.9 
 
 		 417 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  82.73 
 
 		 417 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  79.14 
 
 		 417 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  74.1 
 
 		 417 aa  679    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  83.45 
 
 		 417 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  83.21 
 
 		 417 aa  747    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  95.92 
 
 		 417 aa  843    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  79.14 
 
 		 417 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  73.38 
 
 		 417 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  82.97 
 
 		 417 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  74.1 
 
 		 417 aa  676    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  81.53 
 
 		 417 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  81.29 
 
 		 417 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  74.82 
 
 		 417 aa  675    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  77.22 
 
 		 417 aa  700    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  73.38 
 
 		 417 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  76.26 
 
 		 417 aa  690    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  70.12 
 
 		 435 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  70.12 
 
 		 435 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  68.27 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  68.19 
 
 		 435 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  68.19 
 
 		 435 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  61.45 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  59.23 
 
 		 390 aa  518  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  57.83 
 
 		 475 aa  509  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  58.13 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  58.27 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  59.13 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  59.52 
 
 		 403 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  58.13 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  58.13 
 
 		 396 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  58.41 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  58.61 
 
 		 396 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  58.27 
 
 		 396 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  58.89 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  58.17 
 
 		 393 aa  504  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  56.73 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  58.21 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  58.03 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  57.83 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  58.03 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.59 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  57.45 
 
 		 398 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  58.17 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.93 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.45 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  57.35 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  57.21 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  57.45 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  56.49 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  57.35 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.69 
 
 		 396 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  56.97 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  57.93 
 
 		 416 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  57.21 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  57.42 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  57.11 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  58.07 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  58.65 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  56.12 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  56.97 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  56.73 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  56.87 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>